No mesmo ano, Vinícius Munhoz trabalhou como Assistente de Preparação Física do time profissional do Inter-SM que jogou a Divisão de Acesso do Campeonato Gaúcho e a Copa João Havelange, modulo branco. Em 2001, o santa-mariense seguiu defendendo as cores da equipe da cidade. Ele foi novamente Assistente de Preparacao Fisica do time profissional que disputou a Divisão de Acesso do Campeonato Gaúcho e Preparador Físico da equipe de juniores no Campeonato Estadual de 2001 e na 1ª Copa Coração do Rio Grande. “Vini”, como é conhecido entre os amigos, manteve-se à frente das categorias de base e auxiliando o time profissional do Inter-SM no ano de 2002.
No ano seguinte, o gaúcho deu vôos mais altos. Em 2003, ele fez estágio, com o consagrado Moraci Santanna, na equipe profissional do Sport Club Corinthians Paulista(SP) que disputou o Campeonato Paulista e a Copa Libertadores da América daquele ano. Logo após, Vinícius Munhoz voltou para o seu estado, onde foi convidado pelo Grêmio Football Portoalegrense (RS) para ser um dos seus Preparadores Físicos da equipe gaúcha. No Grêmio, Vinicius participou do Campeonato Brasileiro 2003 e Copa Sul-Americana 2003. O trabalho teve sequência em 2004, onde Vinicius defendeu as cores do tricolor gaúcho no Campeonato Estadual, Copa do Brasil e Campeonato Brasileiro.
No inicio do ano de 2005, o santa-mariense foi convidado pela Confederação Brasileira de Futebol (CBF) para ser preparador físico e Assistente Técnico da Seleção Brasileira de Futebol Feminino Sub-20, onde mais tarde sagrou-se Campeão Sul-Americano da categoria (Chile) e terceiro colocado na Copa do Mundo de Futebol Feminino sub-20 (melhor campanha da história da Seleção Brasileira Sub-20 em Mundiais), na Rússia, competição organizada pela FIFA. Ele também foi o Preparador Fisico da Seleção Brasileira de Futebol Feminino Adulta, prestando serviços para a CBF até o ano de 2006.
Em 2007 e 2008, nova passagem pelo futebol gaúcho. Professor Vinícius esteve à frente da Preparação Física do Clube Esportivo de Bento Gonçalves (RS) na Série C do Campeonato Brasileiro (melhor campanha da historia do clube) e no Campeonato Gaúcho. No ano seguinte, novo convite da Confederação Brasileira de Futebol (CBF) para coordenar novamente a Preparação Física da Seleção Brasileira de Futebol Feminino que participou das Olimpiadas de Pequim 2008. Vini foi finalista Olímpico e conquistou a medalha de prata.
Desde fevereiro de 2009, o professor Vinícius Munhoz, é Preparador Físico e Assistente Técnico do Saint Louis Athletica, equipe de Futebol Feminino da cidade de Saint Louis, estado do Missouri, que disputa a Womens Professional Soccer (WPS), considerada a melhor liga de futebol feminino do mundo. Vinicius Munhoz vai para sua segunda temporada no Saint Louis Athletica e espera um desempenho ainda melhor do que em 2009, onde o gaúcho conquistou o 2º lugar na Regular Season 2009(Fase de Pontos Corridos) e o 3º lugar na fase de playoffs.
